教育经历

2000.09-2005.07    北京大学，研究生，博士学位

1996.09-2000.06    北京大学，本科，学士学位

工作经历

2017.05-至今          中国科学院武汉病毒所研究员、学科组长、博士生导师

2016.09-至今          中国科学院大学、岗位教授

2009.07-2017.12    中国科学院微生物研究所、助理研究员、副研究员、研究员

2005.12-2009.06    中国科学院微生物研究所、博士后

学术兼职

Virologica Sinica编委；

Biosafty and Health编委；

研究内容

主要从事病原微生物与生物信息学研究。在病原体基因组特征与进化规律研究、微生物组学研究等研究方向有一系列相关研究工作。相关研究揭示了包括禽流感病毒、埃博拉病毒、登革热病毒等的基因组演化规律，建立了病毒宿主内进化的研究方法；开发了基于宏转录组技术的呼吸道病原体研究方法，揭示了腺病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒、肺炎支原体等病原体的基因组特征和流行规律。

主持项目

1. 国家重点研发计划项目

   课题名称: 高致病生物威胁因子检测关键技术和数据库研究

   资助金额: 14,837,000人民币

   
   

2. 国家重点研发计划项目

   课题名称: DNA活字喷墨与阵列存储技术研究及示范系统

   资助金额: 18,590,000人民币

   
   

3. 国家重点研发计划项目

   课题名称: 国家生物安全监测网络系统集成技术研究

   资助金额: 9,930,000人民币

   
   

4. 湖北省创新群体项目

   课题名称: 儿童呼吸道感染病原谱筛查

   资助金额: 500,000人民币

成果（限10篇）#并列第一作者，*通讯作者）

1. Sun B, Xu M, Jia L, Liu H, Li A, Hui L, Wang Z, Liu D*, Yan Y*. Genomic variants and molecular epidemiological characteristics of dengue virus in China revealed by genome-wide analysis. Virus Evol (5.5). 2025 Mar 17;11 (1):veaf013. doi: 10.1093/ve/veaf013.

2. Huang J, Li Y, Chen H, Liu H, Li W, Isiaka ID, Du H, Noman M, Rizwan MA, Du Q, Li Y, Lin Y, Liu Y, Lu X*, Liu D*, Yan Y*. Epidemiological, Clinical, and Genomic Traits of PIV in Hospitalized Children After the COVID-19 Pandemic in Wuhan, China. J Med Virol (6.847). 2024 Dec;96 (12):e70117. doi: 10.1002/jmv.70117.

3. Sun B, Ni M, Liu H, Liu D*. Viral intra-host evolutionary dynamics revealed via serial passage of Japanese encephalitis virus in vitro. Virus Evol (5.614). 2023 Mar 28;9 (1):veac103. doi: 10.1093/ve/veac103. Erratum in: Virus Evol (5.5). 2023 Nov 30;9 (2):vead071. doi: 10.1093/ve/vead071.

4. Lu B, Yan Y, Dong L, Han L, Liu Y, Yu J, Chen J, Yi D, Zhang M, Deng X, Wang C, Wang R, Wang D, Wei H, Liu D*, Yi C*. Integrated characterization of SARS-CoV-2 genome, microbiome, antibiotic resistance and host response from single throat swabs. Cell Discov (5.787). 2021 Mar 30;7 (1):19. doi: 10.1038/s41421-021-00248-3.

5. Lu X#, Zhang L, Du H, Zhang J#, Li YY, Qu J, Zhang W, Wang Y, Bao S, Li Y, Wu C, Liu H, Liu D#, Shao J, Peng X, Yang Y, Liu Z, Xiang Y, Zhang F, Silva RM, Pinkerton KE, Shen K, Xiao H, Xu S, Wong GWK; Chinese Pediatric Novel Coronavirus Study Team. SARS-CoV-2 Infection in Children. N Engl J Med (70.67). 2020 Apr 23;382 (17):1663-1665. doi: 10.1056/NEJMc2005073.

6. Yuan J#*, Chen C#, Cui J#, Lu J#, Yan C, Wei X, Zhao X, Li N, Li S, Xue G, Cheng W, Li B, Li H, Lin W, Tian C, Zhao J, Han J, An D, Zhang Q, Wei H, Zheng M, Ma X, Li W, Chen X, Zhang Z, Zeng H, Ying S, Wu J, Yang R*, Liu D*. Fatty Liver Disease Caused by High-Alcohol-Producing Klebsiella pneumoniae. Cell Metab (22.415). 2019 Oct 1;30 (4):675-688.e7. doi: 10.1016/j.cmet.2019.08.018.

7. Ni M, Chen C, Qian J, Xiao HX, Shi WF, Luo Y, Wang HY, Li Z, Wu J, Xu PS, Chen SH, Wong G, Bi Y, Xia ZP, Li W, Lu HJ, Ma J, Tong YG, Zeng H, Wang SQ*, Gao GF*, Bo XC*, Liu D*. Intra-host dynamics of Ebola virus during 2014. Nat Microbiol (20.5). 2016 Sep 5;1 (11):16151. doi: 10.1038/nmicrobiol.2016.151.

8. Tong YG#, Shi WF#, Liu D#, Qian J#, Liang L#, Bo XC#, Liu J, Ren HG, Fan H, Ni M, Sun Y, Jin Y, Teng Y, Li Z, Kargbo D, Dafae F, Kanu A, Chen CC, Lan ZH, Jiang H, Luo Y, Lu HJ, Zhang XG, Yang F, Hu Y, Cao YX, Deng YQ, Su HX, Sun Y, Liu WS, Wang Z, Wang CY, Bu ZY, Guo ZD, Zhang LB, Nie WM, Bai CQ, Sun CH, An XP, Xu PS, Zhang XL, Huang Y, Mi ZQ, Yu D, Yao HW, Feng Y, Xia ZP, Zheng XX, Yang ST, Lu B, Jiang JF, Kargbo B, He FC, Gao GF, Cao WC; China Mobile Laboratory Testing Team in Sierra Leone. Genetic diversity and evolutionary dynamics of Ebola virus in Sierra Leone. Nature (48.5). 2015 Aug 6;524 (7563):93-6. doi: 10.1038/nature14490.

9. Cui L#, Liu D#, Shi W#, Pan J, Qi X, Li X, Guo X, Zhou M, Li W, Li J, Haywood J, Xiao H, Yu X, Pu X, Wu Y, Yu H, Zhao K, Zhu Y, Wu B, Jin T, Shi Z, Tang F, Zhu F, Sun Q, Wu L, Yang R, Yan J, Lei F, Zhu B, Liu W, Ma J, Wang H, Gao GF. Dynamic reassortments and genetic heterogeneity of the human-infecting influenza A (H7N9) virus. Nat Commun (11.47). 2014;5:3142. doi: 10.1038/ncomms4142.

10. Liu D#, Shi W#, Shi Y, Wang D, Xiao H, Li W, Bi Y, Wu Y, Li X, Yan J, Liu W, Zhao G, Yang W, Wang Y, Ma J, Shu Y, Lei F, Gao GF. Origin and diversity of novel avian influenza A H7N9 viruses causing human infection: phylogenetic, structural, and coalescent analyses. Lancet (39.207). 2013 Jun 1;381 (9881):1926-32. doi: 10.1016/S0140-6736 (13) 60938-1. Epub 2013 May 1.

奖励

2017：中华预防医学会科学技术一等奖

2017：国家科技进步特等奖。